Los objetivos más destacados que se persiguen con el Master son los siguientes: Formar un nuevo colectivo de especialistas en gestión de la I+D+i, con una fuerte orientación práctica, que ayuden a mejorar la capacidad innovadora de las empresas y organizaciones andaluzas. Fomentar un nuevo yacimiento de empleo, promoviendo en el mercado laboral la figura del "gestor de innovación" o "asesor-consultor de innovación", de reciente y creciente desarrollo en otros países europeos. Contribuir al desarrollo de profesionales formados en el paradigma de la gestión del conocimiento y la innovación, que después integren este estilo de gestión en las empresas y organizaciones donde trabajen en el futuro. Impulsar proyectos innovadores y estudios de interés para las empresas, como parte de la formación de los participantes en el Master. Difundir nuevas técnicas y herramientas para la promoción de la innovación en las organizaciones andaluzas que se interrelacionen con el Master.